What it means, How it Works, and What the Current issues are

Nama : Supriadi Yahya

NIM : J1C108036

Biodiversity

Keanekaragaman hayati menunjukkan kekayaan dan keanekaragaman dari semua makhluk hidup. Istilah keanekaragaman hayati yang berarti variabilitas total kehidupan. Pentingnya keanekaragaman hayati pada awal 1990-an menjadi subyek perjanjian internasional seperti the Convention on Biological Diversity adopted in Rio de Janeiro in Convention on Biological Diversity yang diadopsi di Rio de Janeiro di 1992. 1992. Sekarang semakin banyak bukti dari potensi dan dampak pemanasan global pada spesies dan ekosistem yang berbeda hanya mempertinggi kebutuhan untuk mengintegrasikan keanekaragaman hayati dalam kebijakan kompleks.

Keanekaragaman hayati dibagi menjadi tiga tingkatan spesies penyelamatan, keragaman genetik, dan ekosistem. Kategori pertama mengacu pada keragaman dan kelimpahan spesies di wilayah geografis. Genetic mengacu pada variasi keanekaragaman antara dan di dalam spesies, baik antara populasi dan antar individu dalam suatu populasi. karakteristik adalah mekanisme utama evolusi biologis. Ekosistem atau keanekaragaman sistem mengacu pada variasi antara comunities masyarakat dan asosiasi mereka dengan lingkungan fisik. Setiap spesies memiliki fungsi yang berbeda dalam masyarakat mereka. Namun beberapa spesies tidak dapat digantikan dengan yang lain (keystone spesies) karena berperan dalam jaringan makanan dan tidak dapat dihapus. Sebuah contoh adalah spesies kunci serigala abu-abu efek dari reintroduksi serigala abu-abu menunjukkan peran yang tidak proporsional dalam membentuk ekosistem. Ketika serigala tidak hadir maka jumlah rusa akan membesar dalam jangka waktu yang singkat.

How biodiversity works

Ekologi umumnya mempertimbangkan untuk meningkatkan kekayaan spesies ekosistem productivity, stability, and resiliency. Hasil dari lapangan jangka panjang menunjukkan bahwa meskipun kekayaan spesies dan hasil persaingan antarspesies dapat menyebabkan fluktuasi spesies individu. Keragaman cenderung meningkatkan stabilitas produktif ekosistem secara keseluruhan.

Ekosistem yang beragam juga umumnya memiliki tingkat relatif tinggi proses ekosistem dan menghasilkan lebih banyak biomassa yang kurang beragam. Namun, kenaikan tingkat proses ekosistem tidak konstan dan tampaknya relatif stabil pada tingkat rendah spesies. Selain itu, sulit untuk memprediksi besarnya, atau bahkan arah dari efek menghilangkan atau menambahkan spesies tertentu.

Ketahanan ekosistem memiliki dua makna dalam ekologi. Pertama, dapat didefinisikan sebagai gangguan besar yang dapat diserap oleh ekosistem sebelum perubahan ke ekuilibrium lain. Kedua, ketahanan adalah tingkat di mana ekosistem kembali ke ekuilibrium setelah gangguan. Beberapa komponen keanekaragaman spesies menentukan efek yang sebenarnya. Saat ini pengetahuan tentang konsekuensi dari keanekaragaman hayati sebenarnya terbatas, terutama ketika mempertimbangkan besar perubahan ekosistem dan keanekaragaman hayati.

Where Do things Stand ?

Amerika serikat memiliki kekayaan alam yang besar untuk kisaran wilayah yang besar dan tofografi yang luas. Amerika Serikat cenderung memiliki kekayaan spesies yang lebih besar didaerah selatan dan berkurang secara bertahap ke arah utara. Hal ini juga serupa dengan keanekaragaman hayati global yang meningkat dari kutub ke khatulistiwa.

Secara global, banyak pertanyaan dasar yang berhubungan dengan status keanekaragaman hayati yan tetap tidak terjawab. Sebagai contoh, kurang dari dua juta singa spesies di dunia yang benar-benar diakui dan dijelaskan. Namun, mereka hanya merupakan beberapa bagian dari jumlah ketal spesies di dunia, yang tidak diketahui dan harus diestimasi

What Is Being Lost ?

Kepunahan spesies adalah contoh paling konkret hilangnya keanekaragaman hayati. Suatu spesies disebut punah bila anggota terakhir meninggal.Kapan hanya beberapa individu dari suatu spesies ada, bahwa spesies bisa menjadi punah secara fungsional, yang berarti bahwa reproduksi dan panjang. Kelangsungan hidup spesies itu menjadi mustahil. Sebuah spesies menjadi punah di alam liar saat satu-satunya milik individu-individu hidup yang spesies yang dipelihara dalam lingkungan yang tidak alami, seperti kebun binatang

Teori ekologi menunjukkan bahwa beberapa faktor yang berkontribusi pada kerentanan spesies tertentu kepunahan. Spesies yang paling rentan terhadap kepunahan meliputi organisme besar, spesies dengan rentang populasi kecil atau populasi, dan spesies yang telah berevolusi dalam isolasi.

The Human Factor

Penyebab utama penurunan keanekaragaman hayati kontemporer habitat perusakan dan degradasi, didorong oleh ekspansi manusia. Hilangnya habitat adalah penyebab utama membahayakan untuk 85 persen dari spesies yang terdaftar di bawah Endangered

Species Act (ESA

Aktivitas manusia juga menimbulkan polusi kimia sebagai contoh, perkotaan, pertanian, dan sering pelepasan nitrat dalam jumlah besar ke sistem perairan, di mana mereka menyebabkan ganggang bunga tersedak oksigen dan keteduhan spesies lain. Perubahan iklim global, yang disebabkan oleh akumulasi atmosfer manusia yang dihasilkan gas rumah kaca,yang menyebabkan hilangnya keanekaragaman hayati. Meskipun banyak spesies mempunyai kemampuan untuk beradaptasi dengan perubahan lingkungan. Pergeseran suhu dan curah hujan bisa memiliki berbagai dampak terhadap keanekaragaman hayati termasuk perubahan dalam pola migrasi dan pembiakan.

Integrating Economics and Ecology to Help Preserve Biodiversity

Satu kepastian dalam menentukan jangka panjang sesuai keanekaragaman hayati. Mengidentifikasi strategi untuk melestarikan keanekaragaman hayati memerlukan ditegrating economics and ecology, sebagai contoh, sistematis konservasi bertujuan untuk mengidentifikasi biaya untuk mencapai tujuan konservasi yang spesifik.

Kebijakan konservasi keanekaragaman hayati membantu dalam menemukan pendekatan praktis untuk melindungi keanekaragaman hayati. Misalnya untuk melestarikan keanekaragaman hayati dalam bekerja lanskap menggunakan easements mungkin dicapai relatif murah dibandingkan dengan pelestarian penuh melalui akuisisi atau peraturan larangan. Pendekatan untuk konservasi dengan insentif ekonomi untuk melindungi keanekaragaman hayati dapat membuktikan secara ekonomi dan ekologis.

Penilaian konservasi keanekaragaman hayati mungkin berbeda menurut lokasi, tergantung pada alam yang unik. Dan mereka jelas tidak definitif karena pengetahuan yang terbatas dan metode yang tidak sempurna. Tapi pertanyaan ini menyediakan informasi yang relevan, dalam konteks pertimbangan lain dan membantu mengidentifikasi pembuat keputusan

Glycine N-methyltransferase is an Example of Fungsional Diversity

Nama : Supriadi Yahya
NIM : J1C108036
Prodi : BIOLOGI

Glycine N-methyltransferase is an Example of Fungsional Diversity

Sitokrom P-4501A1 (CYP1A1) baru ini diidentifikasi sebagai N-methyltransferase glisin (GNMT). Peran GNMT sebagai 4 S PAH-mengikat protein menengahi induksi sitokrom P-4501A1 telah diselidiki lebih lanjut. Beberapa klon positif dipilih oleh reverse transcription-polymerase chain reaction dan diuji untuk ekspresi protein rekombinan. Barat noda analisis menunjukkan ekspresi signifikan tingkat dari 4 S protein dalam transfected CHO ke sel (CHO-GNMT). Tidak ada pesan reseptor Ah atau protein yang terdeteksi dalam CHO CHO-neo, atau GNMT CHO-sel. Penelitian ini tegas menetapkan bahwa adalah GNMT PAH-binding protein yang dapat menengahi induksi CYP1A1 oleh PAHs seperti B [a] P melalui reseptor-independen Ah jalur.

Polycyclic aromatic hydrocarbon seperti B [a] P1, 3 methylcholanthrene, dan TCDD adalah polusi lingkungan yang mendatangkan berbagai macam racun, teratogenic, dan karsinogenik. Selain itu , beberapa di antaranya dapat berinteraksi dengan DNA, sehingga berpotensi mengaktifkan protooncogenes atau menonaktifkan gen supresor tumor.

GNMT pertama kali ditemukan dalam ekstrak hati guinea babi dan didalilkan untuk terlibat dalam oksidasi metil karbon dari metionin, meskipun jalur ini dihitung hanya 20% dari total metil metabolisme metionin. Dalam sebuah studi Cook danWagner , GNMT ditunjukkan bertindak sebagai folatebinding protein dalam sitosol hati tikus. Tikus GNMT homotetramer terdiri dari 33-kDa subunit tersedia media mengikat independen untuk S-adenosylmethionine, glisin, dan folat dan juga untuk B [a] P (34). Bentuk enzimatik GNMT, yaitu homotetramer, dan monomer tidak dapat berfungsi baik enzimatik atau sebagai B [a] P pengikat.

MATERIALS AND METHODS

Bahan kimia- medium kultur jaringan, sebagai berikut serum janin sapi, gentamycin, geneticin (G418), dan Lipofectin. Sumber bahan lain [a-32P] dATP dari ICN biokimia (Irvine, CA);[3H]B[a]P (60 Ci / mmol) dari Amersham Corp; [3H] TCDD (41 Ci / mmol) dari Chem-Syn Science Labs (Lenexa, KS); Immobilon P dari Millipore (Bedford, MA); S & S mentransfer membran dari Schleicher & Schuell (Keene, NH); BM Chemiluminescence blotting Barat kit dari Biochemica Boehringer Mannheim Corp (Indianapolis, IN); Tris, TEMED,Tween 20, B [a] P, B [e] P, 3-methylcholanthrene, TCDD, Isositrat dehidrogenase, nikotinamida, ethoxyresorufin, dan resorufin dari Sigma.

HASIL

Sel CHO dipilih sebagian sebagai target untuk transformasi karena kurangnya ekspresi gen endogen dan GNMT efisiensi transfection dengan pMAMneo / GNMT menggunakan Lipofectin teknik. 35 neomisin-klon resisten secara acak dipilih, terisolasi, dan tumbuh menjadi budaya massa untuk karakterisasi lebih lanjut. Penyaringan awal dilakukan oleh RT-PCR analisis dari klon G418-tahan untuk 4 S PAH-binding protein dan b-aktin ekspresi gen.

Pada Sel CHO-GNMT-Untuk menentukan secara langsung jika sel GNMT CHO-GNMT memproduksi protein, selular total protein denaturating dianalisis dengan elektroforesis gel, dan protein yang ditransfer ke nitroselulosa membran dan menggali afinitas-disucikan dengan antibodi poliklonal untuk GNMT. CHO-GNMT sel mengekspresikan tingkat signifikan bila dibandingkan dengan GNMT tingkat yang tidak terdeteksi ada pada jalur d atau CHOneo (jalur c). Kepadatan sukrosa Analisis Gradient B [a] P dan TCDD Binding Kegiatan-Spesifik B [a] P dan mengikat TCDD kegiatan ditentukan dalam berbagai sel CHO. Spesifik kegiatan mengikat TCDD ditetapkan dalam cytosolic ekstrak dari kontrol positif, HEPA-1 sel hepatoma. Pada dasarnya tidak ada kegiatan mengikat TCDD diamati di ekstrak baik dari CHO-GNMT (jalur 2), CHO-neo (data tidak ditampilkan), atau CHO (data tidak ditampilkan) sel.

Pembentukan reseptor XRE-Ah juga dibuktikan dengan ekstrak nuklir dibuat dari HEPA-1 sel yang telah diperlakukan in vivo dengan TCDD (jalur 4). Sekali lagi, tidak kompleks seperti diamati dengan diobati TCDD-CHO-GNMT ekstrak nuklir (jalur 8). Hasil ini jelas menunjukkan bahwa sel CHO-kurangnya GNMT setiap endogen Ah ekspresi reseptor dan bahwa PAH-induced ekspresi CYP1A1 terjadi melalui sebuah Ah receptorin dependent jalur.

DISCUSSION

The 4 S PAH-binding protein diidentifikasi sebagai GNMT pada dasar beberapa kriteria, termasuk pemurnian, pengurutan, immunoprecipitation dari PAH aktivitas mengikat antibodi poliklonal untuk GNMT, dan copurification dari dua protein dalam berbagai sel dan jaringan. Penelitian ini dirancang untuk memperkenalkan GNMT gen ke dalam sel yang tidak memiliki kemampuan untuk mengekspresikan protein ini serta reseptor Ah. Sel-sel kemudian akan menyediakan model biologis yang cocok untuk menguji induksi oleh PAHs seperti B [a] P dan 3-methylcholanthrene. Hasil studi ini memberikan informasi langsung peran fungsional sebagai GNMT PAH-binding protein yang dapat menengahi induksi CYP1A1.

GNMT itu diperkenalkan secara stabil ke CHO (D422) sel, yang tidak memiliki ekspresi endogen protein serta Ah reseptor, melalui plasmid yang berisi virus Moloney ulangi terminal lama sebagai promotor dan neomisin menunjukkan perlawanan sebagai pilihan penanda. Jika hipotesis GNMT, yaitu 4 S PAH-mengikat protein, sebagai mediator dari PAH-induksi ekspresi CYP1A1 berlaku, sistem sekarang harus menanggapi B [a] P dalam yang sesuai cara.

GNMT juga telah diusulkan sebagai modulater ekspresi gen oleh metilasi dari substrat yang belum belum teridentifikasi . Bisa dibayangkan bahwa GNMT dapat bertindak tidak langsung dalam modulasi B [a] P-induksi ekspresi CYP1A1 methylating diketahui oleh substrat yang dapat mempengaruhi gen, karena hypermethylation telah ditunjukkan oleh banyak laboratorium untuk mempengaruhi aktivitas gen

Sebagai kesimpulan telah ditunjukkan bahwa GNMT adalah PAH-binding protein yang menjadi perantara induksi CYP1A1 oleh Ah reseptor-jalur independen. Penyelidikan tambahan diperlukan untuk lebih memahami faktor-faktor yang mengatur GNMT jumlah dan karena itu dimerik mengendalikan ekspresi dari CYP1A1.

.